在农机遭遇水淹后，如何妥善处理并进行维修是一个需要关注的问题。首先，在发现农机被水淹时，应立即停止使用，并根据购买的保险情况尽快联系保险公司。接着，将机器移动到干燥、平坦的地面，并及时联系购置该农机的代理店。

接下来是具体的维修步骤：

清洁杂物：将农机上的泥土和水分彻底清理干净，以便于后续操作。

电气系统：检查所有电线和插头，确保它们是干燥且没有损坏。如果有疑问，可以更换相关部件。此外，还需检查是否存在短路等问题。

油路系统：更换燃油，同时清洗低压油路，并更换燃油滤芯，以保证流动性和效率。

液压系统：检查液压系统，如出现进水则需更换液压油箱内及变速箱内的液压油以及液压油滤芯。

发动机：

检查发动机进气管及其空气滤芯，如果有积水，则清扫或更换。

拆下预热塞或火花塞，让发动机会排出内部积水。

更换发动机用途中的新鲜机油以及对应的滤芯。

以上步骤完成后，再次启动发动机关照10分钟左右，然后再次更换一次新的机油及滤芯，以及液壓系統中的相關零件直至无乳化现象出现。在整个过程中要定期檢查機械運作狀態並調整必要之處以維持最佳性能。

在准备使用之前，还需要进行一系列检查工作：

在春季重新启用农具前，对其进行全面的检查，从清理杂物、调整零件到加强结构和润滑机械部位都要做好准备，以确保经过休眠后的正常运行与安全性考虑不受影响。

检查重要配件如悬挂装置螺栓、轮胎紧固螺母等是否松動；轮胎气压是否适当；传导带张紧度与风扇皮带张紧度也同样要检验。同时，要确认操纵手柄（主离合操纵杆、液压提升操纵杆）能够自由分离，而连接件、传送部分必须牢固，没有松弛或脱焊迹象。

对金属零件细致地进行修复工作，包括润滑剂更新、新建发动机构系清洁过滤器替换新过滤层等。务必采用符合标准规格的润滑剂，不断保持空气过滤器与含有精密微孔网目的小型过滤设备（如齿轮泵）的有效功能；通过毛刷每日轻柔地擦拭这些组成部分以防止沉积污垢。而对于关键位置上的汽门间隙就得仔细观察并必要时去除任何积碳累存而产生阻碍效果。此外，对于汽门弹簧每月至少进行一次测试，即弹簧失去弹性的那一刻应该立即予以更新改善从而避免因弹簧老化导致农业生产工具长期停运状态下降低整体效率造成经济损失的情况发生。