红豆杉的产地分布主要集中在北半球，除了一种澳洲的品种外，其余均为北半球产物。中国境内有四种红豆杉及其一变种，广泛分布于中国大部分地区。东北红豆杉以吉林省长白山及黑龙江一带以及辽宁东部山区为主栖息地，而云南红豆杉则主要分布于滇西与地州16个县总面积约9万平方公里之处，以其广泛而分散的生长特点著称。南方红豆杉又以滇东、滇西南及滇东纯林为主要栖息区域。

然而，20世纪90年代初期，一家美国公司发现了紫杉醇这项抗癌成分后，对于这种树木的疯狂剥皮行为导致大量自然资源遭到破坏。此前，《云南省珍贵树种保护条例》并未引起足够重视，因此许多生命在短时间内丧失。这促使国家林业局对“红豆杉工程”进行了明确指示，鼓励社会各界参与造林绿化事业，并支持建立适量的大片红豆杉森林。

值得一提的是，有两处被评定为国家级自然保护区：梁野山国家自然保护区是中国首个专门针对红豆杉进行保护的地方，也是唯一一个以南方红豆杉为重点对象的国家级自然保护区。而穆棱东北红bean植物保存所位于2009年成为国家级自然保护区，该地区因其独特的地理位置和生物多样性，被誉为“植物界大熊猫”的16万余株东北red bean将得到更好的保障和管理。