在花球上，最初会出现类似水渍的小黄点，这些点随后会扩大，并长出黑色的霉状物，这正是病原菌的子实体。这种情况如果发展得严重，一朵花球上可能会有几十个这样的黑斑。当感染发生时，植物组织就会腐烂，但这个过程相比其他疾病来说要慢一些。在贮藏期间，有时候这些病斑会被灰葡萄孢再次寄生，从而产生混生的灰色霉状物，加速了腐烂的进程。

此种疾病的罪魁祸首是一种名为芸薹生链格孢（Alternaria brassicicola）的半知菌亚门丝孢纲链格孢属的微生物。它主要通过田间采收时叶上的病菌沾染到花球上引起感染。这株微生物最适宜于25至30摄氏度之间、高湿度环境中繁殖。而虽然高湿度可以减少植物失去水分的情况，但这也促使了黑斑病的发生率显著增加。此外，将花椰菜和青花菜密封在薄膜袋内实际上加剧了这种问题。

为了防止这一疾病，在田间采收前务必做好防护措施。在晴朗天气条件下进行采摘，并且在将其带入储存之前，应及时剪除那些已经受损的小叶片。保持储存温度在0至1摄氏度之间，可以让它们保存6至8周，同时也能推迟它们室温下发生黄化的问题。如果使用的是密封薄膜袋包装，那么应该在袋内放置含有仲丁胺滤纸，每个滤纸约为2平方厘米，即相当于0.08毫升仲丁胺。这通常可以保证50至60天的保鲜期，或许还能加入适量饱和高锰酸钾，以吸收乙烯并提高效果。而采用有孔透气薄膜袋包装则能够有效降低发病率相较于全封闭型包装。