在花球上，最初会出现类似水渍的小黄点，这些点随后会扩大，并长出黑色的霉状物，这正是病原菌的子实体。这种情况如果发展得严重，一朵花球上可能会有几十个这样的黑斑。当感染的组织开始腐烂时，虽然腐烂速度不快，但这对植物来说仍是一个巨大的威胁。更糟糕的是，有时候在贮藏期间，灰葡萄孢还会再次寄生于这些病斑之中，使其变成灰色的霉状物，从而加速了腐烂过程。

负责这一切的病原菌是一种名为芸薹生链格孢（Alternaria brassicicola）的半知菌亚门丝孢纲链格孢属生物。这种生物主要通过田间采收时叶上的污染物沾到花球上来侵染植物。在25到30摄氏度的适温下，它们可以迅速繁殖，而且高湿度虽然能减少植物失水，但同时也使得黑斑病更加容易发生。此外，如果将这些花椰菜或青花菜装入密封袋中，这样的环境条件实际上有助于病菌的繁殖和传播。

为了防止这种疾病，我们需要在田间采取预防措施。在晴朗天气下采摘，以此减少被污染的风险。入库前要清除任何看起来已经受损的小叶片，并进行预冷处理，然后控制贮存温度保持在0至1摄氏度。这通常能够让它们保持可食用状态达6至8周，同时也能延缓室温下的黄衰现象。而且，如果使用薄膜袋密封包装，可以加入含有仲丁胺滤纸，即每个滤纸约0.08毫升，以此来降低发病率。或者加入适量饱和高锰酸钾以吸收乙烯效果更佳。不过，用打孔薄膜袋包装比全封闭型显著减少了发病率。