在花球上，最初表现为水渍状的黄色点，随后扩大并长出黑色的霉状物，这是病原菌产生的子实体。严重时，一朵花球上可能会有数十个黑斑。当组织感染时，它们会腐烂，但腐烂的速度相对较慢。在贮藏期间，有时候病斑会被灰葡萄孢再次寄生，使得灰色的霉状物出现，加速了腐烂过程。

病原菌属于半知菌亚门中的丝孢纲链格孢属——芸薹生链格孢（Alternaria brassicicola）。

发病通常发生在采收后的贮藏阶段，主要是因为田间采收时叶上的病菌沾染到花球上引起。这种侵染适宜于25至30摄氏度的温度和高湿度环境。如果装入薄膜袋密封，不仅不会减少花椰菜或青花菜失水，还会显著增加黑斑病的发生率，因此需要控制好入库前叶片的健康状况，并进行预冷处理，将温度控制在0至1摄氏度下，可以将其保鲜时间延长至6至8周。此外，这也能推迟出库后室温下的黄衰发生。

为了防治，可以在田间采取措施。选择晴朗天气采摘，并且在入库前清除所有有症状的小叶片。此外，可进行预冷处理，并将贮存温度控制在0-1摄氏度，以延长保鲜期限，同时减缓出库后黄衰的情况。

如果使用薄膜袋包装，可以加入浸过仲丁胺滤纸，每平方厘米约含0.08毫升。这可以使其可持续贮存50-60天，或加入适量饱和高锰酸钾，以吸收乙烯效果更佳。而使用具有孔洞设计的薄膜袋包装则比全封闭型包装能够显著降低发病率。