在花球上，最初会出现类似水渍的小黄点，这些点随后会扩大，并长出黑色的霉状物，这正是病原菌的子实体。这种情况如果发展得严重，一朵花球上可能会有几十个这样的黑斑。当感染发生时，植物组织会腐烂，但这个过程相比其他疾病来说要慢一些。在贮藏期间，有时候这些病斑就会被灰葡萄孢寄生而进一步变成灰色的霉状物，从而加速腐烂的进程。

造成这一切的是一种名为芸薹生链格孢（Alternaria brassicicola）的半知菌亚门丝孢纲链格孢属的微生物。这种病菌通常是在采收时通过叶片上的污染进入花球中。它最喜欢在25到30摄氏度之间、湿度较高的环境下繁殖。虽然高湿度可以减少植物失水，但同时也促成了黑斑病的发生。此外，如果将花椰菜和青花菜密封在薄膜袋里，问题就更严重了。

为了防止这一问题，我们需要在田间采取预防措施。在晴朗天气条件下进行收获，并且在存放前清除所有看起来已经受到感染的小叶子。通过预冷处理并将温度控制在0至1摄氏度，我们可以使其可保鲜6至8周，同时延缓出库后植物出现黄色衰老的情况。如果使用薄膜袋包装，可以加入含有仲丁胺滤纸，每个包装中约需2平方厘米这样的滤纸，这样可以让它们保持50至60天不变质。而使用饱和高锰酸钾也有助于吸收乙烯，从而效果更佳。不过，如果使用带孔口的薄膜袋来包装，则与完全封闭型薄膜袋相比能显著减少发病率。