在农机遭遇水淹后，处理和维修步骤需要按照以下的流程进行：

首先，在发现农机被水淹时，应立即停止使用，并且尽可能地将其搬到干燥的地方。对于购买了保险的用户来说，应该第一时间与保险公司联系，以便获得相应的帮助。

接下来是详细的维修步骤：

清理杂物：清除农机表面的泥土、杂物和积水，这有助于避免进一步损害。

电器检查：分开电器插头，让它们自然风干或使用吹风机吹干，同时检查保险丝、插头及其他电器部件是否损坏或短路。如果无法确定，可以更换相关部件。

油路系统：更换燃油，并清洗低压油路系统，以及更换燃油滤芯以确保燃料质量。

液压系统：检查液压系统，如出现进水情况，则需更换液压油箱内和变速箱内的液压油及滤芯。

发动机：

检查发动机进气管及空气滤芯，如果进水则需要清扫并更换。

拆下预热塞或火花塞，将发动机会话启动排出积水。

更换发动机机油以及滤芯。

完成以上操作后，重新安装预热塞或火花塞，然后启动发动机会话运行10分钟左右，再次更换機械設備中的润滑剂和过滤设备直至无乳化现象出现。此外，要定期检查润滑剂是否正常，不要让它长时间处于同一种状态以防乳化发生。

在使用前，还需要进行一些额外的准备工作：

在春季开始之前，对农用机械进行全面检验，包括对机械表面的彻底清洁、零件调整加固、机械运动部分润滑等，以确保经过休眠后的安全性。

检查所有重要部位如悬挂装置螺栓、轮胎紧固螺母是否松动；轮胎气压是否正常；传动带张紧度以及发动机风扇皮带张紧度；操纵手柄（主离合操纵杆、液压提升操纵杆）在分离状态下的灵活性；连接件传递件松垮程度焊接品脱焊情况等。

对金属零件进行细致修复，如润滑调节、发动机关键部位清理过滤器擦拭等。必须使用符合本型号标准的润滑剂，更频繁地对空气过滤网和曲轴箱密封圈做毛刷清洁。监控并调整气门间隙，有必要时去除积碳保持弹簧性能良好，一旦弹簧失去弹性的，就应该立即更新替代新的一套来保证效率不受影响。

加入柴油前最好提前48小时来沉淀其中含有的污渍重金属以免混合进入发動機而影響發動機運行稳定性。在柴油添加过程中一定要选择高质量产品以避免泄露或者回流的问题从而保障農業機械顺利运行。