在花球上，最初表现为水渍状的黄色点，随后扩大并长出黑色的霉状物，这是病原菌子实体的形成。严重时，一朵花球上可能会有数十个黑斑。感染部位会腐烂，但腐败过程相对较慢。在贮藏期间，有时候病斑会被灰葡萄孢再次寄生，从而产生混生的灰霉状物，加速了腐败进程。

病原菌属于半知菌亚门丝孢纲链格孢属，其种名为芸薹生链格孢（Alternaria brassicicola）。

黑斑病通常是在采收后的贮藏过程中发生的，它主要是田间采收时，由于叶上的病菌与花球接触而引起。适宜的侵染温度在25到30摄氏度之间，而高湿度虽然可以减少植物失水，但却促进了黑斑病的发生。因此，即便使用薄膜袋密封包装，也容易加剧问题。

为了防治这一疾病，首先需要在田间采取防护措施。在晴朗天气条件下进行采收，并在入库前去除任何已经出现症状的小叶片。此外，可以通过预冷处理来延长储存期限，使其保持在0到1摄氏度之间，大约可存放6到8周，同时也能推迟出库后室温下的黄衰发生。

如果采用薄膜袋密封包装，还可以将2平方厘米浸透仲丁胺（约0.08毫升）的滤纸加入其中。这一方法通常能够使花椰菜和青花菜保持50到60天不变质。而通过添加适量饱和高锰酸钾来吸收乙烯效果更佳。使用带有孔洞的薄膜袋包装则比全封闭型显著减少了发病率。