增强免疫力

微生物，尤其是某些细菌和真菌，对人类的免疫系统具有不可或缺的作用。它们能够激活免疫细胞，使之更有效地识别并消灭病原体。例如，一些益生菌能帮助维持肠道平衡，有助于预防感冒和其他上呼吸道感染。此外，一些含有线粒体的真菌，如酵母，可以产生抗氧化剂，从而保护身体不受自由基伤害。

改善消化系统功能

通过改善肠道微生物群（也称为肠内环境），我们可以提高营养吸收率，并减少不适。研究表明，某些类型的益生元可以促进肠道健康，减少腹泻、便秘和胃痛等症状。此外，它们还能帮助控制血糖水平，对糖尿病患者至关重要。

提高精神状态

研究显示，大脑与大肠之间存在着神经通路，这意味着我们的情绪甚至思维过程都受到影响。在这方面，正如一些人所说的“大脑有它自己的小肚子”，微生物对心理健康也扮演了角色。它们能够调节情绪、焦虑以及抑郁症状，同时也有助于改善睡眠质量。

增强皮肤保养能力

某些特定的细菌和真菌被发现能够增强皮肤屏障功能，有助于抵御炎红性皮炎及其他敏感性疾病。此外，它们还能协助修复损伤的皮膚组织，并可能通过生产抗炎物质来缓解痒疹和红斑等问题。

鼓励自然杀手细胞活动

一部分微生物可以刺激天然杀手细胞（NK细胞）的活跃，这是一种非常重要的一类白血球，因为它们直接攻击带有病毒或癌细胞表面的异常组织结构。当这些单核巨噬细胞受到刺激时，它们会更加积极地寻找并破坏潜伏在体内但尚未引起症状的病原体。

降低肥胖风险

研究已经证明，即使是轻微增加摄入某些类型的小量益生元，也可能对降低肥胖率产生积极影响。这主要是因为益生元可以改变代谢途径，使身体更加有效地利用食物中的碳水化合物，从而减少脂肪存储。同时，还有一部分细菌能将植物中难以消化的大分子的纤维转变成易于吸收的小分子，有利于提供更多营养素，同时减少饱腹感，让人更容易保持理想体重。