由于天麻花构造特殊，花药（即花粉）被药帽盖住，药帽不会自行脱落，花药黏润成块状不会自行散发，尤其是温室或拱棚栽培育种，很少有昆虫传播活动，所以必须进行人工授粉。天麻实施人工授粉时，为保证授粉的成功率，应遵循开一朵授一朵的原则，授粉时间以上午10时至下午2时为最佳。授粉时，一手轻捏子房，另一手用竹签下压唇瓣，然后挑出花药块，准确地放在平滑的柱头上。同花、同株或异花、异株授粉均可。异花授粉杂交优势强、产量高。人工授粉只要按规程操作，一般授粉成功率在90%以上。