2015年单菌研究文献盘点

随着十年一遇的寒潮过去，气温一天天转暖，寒冷的冬天也随着这阵寒风渐渐过去，气温慢慢开始有了春天的气息。

亲爱的朋友们，你们是否渴望未来新一轮的科研工作呢？ 趁着今年剩下的时间，让我们盘点一下过去一年来单菌领域好的研究成果，可以用来丰富新一年的研究计划~

下表是我们收集的15年单菌经典文献！

2015年单菌领域经典文献

案例分析

案例1：北京型结核杆菌的进化史和全球传播

自然遗传学 doi:10.1038/ng.3195

作者利用来自99个国家的4987个结核分枝杆菌菌株的基因型数据，构建了菌株组合的进化树，并进一步研究了菌株的进化和传播历史。 其中，对有效种群规模的分析表明，工业革命、第一次世界大战和艾滋病毒流行导致了结核分枝杆菌的种群暴发，而20世纪60年代抗生素的兴起对该菌株起到了显着的抑制作用。

图1 结核分枝杆菌菌株进化与地理位置的关系

图2 结核分枝杆菌有效种群规模的演变

案例2：重组驱动的铜绿假单胞菌群体进化

科学报告 doi：10.1038/srep07649

肺纤维囊肿病是一种复杂的多微生物疾病，其中铜绿假单胞菌感染在发病机制中发挥着重要作用。 作者从同一患者体内分离出 44 株临床铜绿假单胞菌菌株，进行基因组测序和比较分析，并研究抗生素耐药性。 他们发现重组在抗生素抗性基因型的进化中发挥着重要作用。 。

图3 铜绿假单胞菌系统发育树及关键基因与参考序列的相似性

图4 菌株相对于参考基因组的重组变异位置信息

案例3：粟酒裂殖酵母重测序

自然遗传学 doi:10.1038/ng.3215

Schizosaccharomycesprombe是真核研究中重要的模式生物，但目前尚未对该菌株的进化史进行系统研究。 作者汇集了过去100年采集的161株野生裂解酵母，通过重测序，从多个角度挖掘了酵母的进化信息，特别是地理分布、驯化起源和表型相关性等方面。 取得了突破性成果。 进步。

图5 真菌采样点分布（左）和基于变异位点的PCA分析（右）

图6 真菌进化模型（左上）、采样时间与进化距离的关系（右上）以及可能的起源时间（下）

结论

一系列精彩案例都聚焦重要的科学问题，秉承严谨的科学思想，运用合适的工具，最终找到答案。 其中，微生物基因组测序分析提供了大量坚实的数据基础，在研究中发挥着重要作用。 如果您有好的材料和研究思路，诺禾致源可以为您提供优质的微生物测序服务，帮助您深入挖掘隐藏在基因组中的信息，找到您关心的问题的答案。

张周浩（微生物部）丨文案

贾红丽丨编辑

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